Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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