Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CDH18Q13634 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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CDH18Q13634 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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