Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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