Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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GRIK2Q13002 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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GRIK2Q13002 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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GRIK2Q13002 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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GRIK2Q13002 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK2Q13002 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GRIK2Q13002 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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