Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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KCNH2Q12809 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNH2Q12809 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNH2Q12809 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNH2Q12809 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNH2Q12809 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNH2Q12809 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNH2Q12809 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNH2Q12809 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNH2Q12809 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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