Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms