Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms