Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FPGSQ05932 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms