Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms