Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ACTBP60709 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ACTBP60709 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ACTBP60709 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ACTBP60709 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ACTBP60709 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ACTBP60709 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ACTBP60709 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ACTBP60709 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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