Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBX4P57082 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBX4P57082 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms