Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms