Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THOP1P52888 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms