Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms