Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms