Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPA9P38646 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms