Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms