Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PLNP26678 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PLNP26678 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms