Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB2P26583 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms