Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 Metazoa_SRP.58-201ENST00000618720 282 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms