Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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