Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRHP20396 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRHP20396 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRHP20396 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRHP20396 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRHP20396 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRHP20396 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRHP20396 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRHP20396 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRHP20396 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms