Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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