Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms