Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTPS1P17812 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms