Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms