Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXB3P14651 LINC00648-204ENST00000557749 443 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LINC01965-201ENST00000412112 1378 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXB3P14651 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXB3P14651 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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