Protein–RNA interactions for Protein: O15417

TNRC18, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC18O15417 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TNRC18O15417 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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TNRC18O15417 AC138781.1-201ENST00000501322 505 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TNRC18O15417 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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TNRC18O15417 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNRC18O15417 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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