Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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