Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FOSB-210ENST00000591858 3658 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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