Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms