Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms