Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CELF4Q9BZC1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms