Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms