Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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