Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms