Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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