Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP88Q99567 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP88Q99567 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms