Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms