Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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