Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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RNF183Q96D59 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF183Q96D59 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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RNF183Q96D59 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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RNF183Q96D59 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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RNF183Q96D59 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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RNF183Q96D59 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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RNF183Q96D59 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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RNF183Q96D59 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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RNF183Q96D59 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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RNF183Q96D59 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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RNF183Q96D59 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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RNF183Q96D59 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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RNF183Q96D59 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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