Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms