Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms