Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SV2AQ7L0J3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SV2AQ7L0J3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SV2AQ7L0J3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SV2AQ7L0J3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SV2AQ7L0J3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SV2AQ7L0J3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SV2AQ7L0J3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms