Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms