Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms