Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPPQ6IPU0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms