Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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