Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms