Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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